Abstract:
В статье описываются итоги эксперимента по выделению ДНК ВПЧ и влагалищной
микробиоты из жидкостной транспортной среды CellScan с использованием российских тест-систем
«ВПЧ Квант-21» и «Фемофлор-скрин» на российском оборудовании (производитель «ДНК-технология», РФ), методом ПЦР. Краткие результаты: в целом, в 17 образцах первой партии биоматериала в
контрольном заборе было зафиксировано 26 генотипов ВПЧ, из них в экспериментальном биоматериале,
полученном из жидкостной транспортной среды CellScan от тех же женщин, выявлено только 16, или
61,5%. Вирусная нагрузка в экспериментальном биоматериале практически ни в одном образце не
соответствовала контрольной. При экстракции ДНК влагалищной микробиоты во всех 13 образцах
наблюдаются значительные расхождения результатов подсчета общей бакмассы: в контрольных
образцах ОБМ практически вдвое выше, чем в опытных, что свидетельствует о потенциальном
разрушении ДНК микроорганизмов, находящихся во взвеси клеток из CellScan. Вывод: результаты
этого эксперимента в целом оценены как неудовлетворительные – наблюдаются большие различия
между опытными и контрольными образцами, не позволяющие реализовать методику экстракции
ДНК ВПЧ и влагалищной микробиоты из жидкостной транспортной среды CellScan даже на уровне
качественного анализа (в режиме да/нет)..
Description:
В статье описываются итоги эксперимента по выделению ДНК ВПЧ и влагалищной
микробиоты из жидкостной транспортной среды CellScan с использованием российских тест-систем
«ВПЧ Квант-21» и «Фемофлор-скрин» на российском оборудовании (производитель «ДНК-технология», РФ), методом ПЦР. Краткие результаты: в целом, в 17 образцах первой партии биоматериала в
контрольном заборе было зафиксировано 26 генотипов ВПЧ, из них в экспериментальном биоматериале,
полученном из жидкостной транспортной среды CellScan от тех же женщин, выявлено только 16, или
61,5%. Вирусная нагрузка в экспериментальном биоматериале практически ни в одном образце не
соответствовала контрольной. При экстракции ДНК влагалищной микробиоты во всех 13 образцах
наблюдаются значительные расхождения результатов подсчета общей бакмассы: в контрольных
образцах ОБМ практически вдвое выше, чем в опытных, что свидетельствует о потенциальном
разрушении ДНК микроорганизмов, находящихся во взвеси клеток из CellScan. Вывод: результаты
этого эксперимента в целом оценены как неудовлетворительные – наблюдаются большие различия
между опытными и контрольными образцами, не позволяющие реализовать методику экстракции
ДНК ВПЧ и влагалищной микробиоты из жидкостной транспортной среды CellScan даже на уровне
качественного анализа (в режиме да/нет)..